53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3022 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1192  myosin-cross-reactive antigen  74.61 
 
 		 655 aa  982    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.108987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1352  myosin-cross-reactive antigen  74.45 
 
 		 655 aa  979    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.856433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3022  myosin-cross-reactive antigen  100 
 
 		 661 aa  1366    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463393  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2256  myosin-cross-reactive antigen  91.05 
 
 		 659 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14733  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2430  myosin-cross-reactive antigen  90.74 
 
 		 659 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0238  myosin-cross-reactive antigen  66.3 
 
 		 667 aa  908    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4805  myosin-cross-reactive antigen  85.51 
 
 		 659 aa  1153    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3601  myosin-cross-reactive antigen  42.6 
 
 		 588 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1063  myosin-cross-reactive antigen  42.83 
 
 		 588 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1351  myosin-cross-reactive antigen  45.57 
 
 		 591 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.26686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0097  myosin-cross-reactive antigen  42.91 
 
 		 591 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0093  myosin-cross-reactive antigen  42.91 
 
 		 591 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1172  myosin-cross-reactive antigen  43.23 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1508  myosin-cross-reactive antigen  42.93 
 
 		 590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0390888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0365  myosin-cross-reactive antigen  42.36 
 
 		 597 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0362  myosin-cross-reactive antigen  41.67 
 
 		 597 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1559  myosin-cross-reactive antigen  42.93 
 
 		 590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0745  myosin-cross-reactive antigen  42.57 
 
 		 597 aa  449  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.207657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0505  myosin-cross-reactive antigen  42.75 
 
 		 590 aa  442  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04700  myosin-cross-reactive antigen  43.23 
 
 		 587 aa  442  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0175  myosin-cross-reactive antigen  41.36 
 
 		 591 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0147  myosin-cross-reactive antigen  40.55 
 
 		 625 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0663  myosin-cross-reactive antigen  41.49 
 
 		 591 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.727351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1029  myosin-cross-reactive antigen  43.25 
 
 		 587 aa  435  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1056  myosin-cross-reactive antigen  40.4 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488016  hitchhiker  0.00102136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0497  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  41.35 
 
 		 590 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1741  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  39.51 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2856  myosin-cross-reactive antigen  41.39 
 
 		 530 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0484  myosin-cross-reactive antigen  40 
 
 		 596 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4631  myosin-cross-reactive antigen  39.71 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1703  myosin-cross-reactive antigen  41.43 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0307897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4626  myosin-cross-reactive antigen  40.15 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139015  normal  0.0304511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1856  myosin-cross-reactive antigen  40.83 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6310  myosin-cross-reactive antigen  40.94 
 
 		 543 aa  379  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1592  myosin-cross-reactive antigen  37.9 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.188608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4625  myosin-cross-reactive antigen  36.64 
 
 		 519 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19626  normal  0.0201148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1715  myosin-cross-reactive antigen  32.84 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10287  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  30.58 
 
 		 556 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.785603 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09297  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03570)  33.59 
 
 		 589 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.17345  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03782  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  29.59 
 
 		 564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  56.25 
 
 		 991 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 		 1126 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_002936  DET0123  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.9 
 
 		 643 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0636906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  44.44 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_131  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  44.9 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000174101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.92 
 
 		 1440 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.83 
 
 		 1410 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  42.59 
 
 		 465 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  47.73 
 
 		 653 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.75 
 
 		 1440 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 600 aa  44.3  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139263  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  44 
 
 		 653 aa  43.9  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.59 
 
 		 465 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>