44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3601 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1063  myosin-cross-reactive antigen  80.44 
 
 		 588 aa  998    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0097  myosin-cross-reactive antigen  52.53 
 
 		 591 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1559  myosin-cross-reactive antigen  53.81 
 
 		 590 aa  660    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0093  myosin-cross-reactive antigen  52.53 
 
 		 591 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0175  myosin-cross-reactive antigen  56.59 
 
 		 591 aa  710    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0147  myosin-cross-reactive antigen  55.11 
 
 		 625 aa  698    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04700  myosin-cross-reactive antigen  59.93 
 
 		 587 aa  706    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0505  myosin-cross-reactive antigen  53.13 
 
 		 590 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1351  myosin-cross-reactive antigen  52.7 
 
 		 591 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.26686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1172  myosin-cross-reactive antigen  77.89 
 
 		 611 aa  957    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3601  myosin-cross-reactive antigen  100 
 
 		 588 aa  1218    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0663  myosin-cross-reactive antigen  52.36 
 
 		 591 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.727351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1056  myosin-cross-reactive antigen  54.9 
 
 		 611 aa  670    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488016  hitchhiker  0.00102136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1508  myosin-cross-reactive antigen  54.31 
 
 		 590 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0390888  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1029  myosin-cross-reactive antigen  51.27 
 
 		 587 aa  632  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4631  myosin-cross-reactive antigen  53.04 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0745  myosin-cross-reactive antigen  50.75 
 
 		 597 aa  621  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.207657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0362  myosin-cross-reactive antigen  51.11 
 
 		 597 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0484  myosin-cross-reactive antigen  49.83 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0365  myosin-cross-reactive antigen  50.94 
 
 		 597 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0497  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  49.75 
 
 		 590 aa  607  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3022  myosin-cross-reactive antigen  42.6 
 
 		 661 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463393  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2256  myosin-cross-reactive antigen  42.78 
 
 		 659 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14733  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4805  myosin-cross-reactive antigen  43.44 
 
 		 659 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2430  myosin-cross-reactive antigen  42.63 
 
 		 659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1352  myosin-cross-reactive antigen  43.34 
 
 		 655 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.856433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1192  myosin-cross-reactive antigen  43.16 
 
 		 655 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.108987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0238  myosin-cross-reactive antigen  41.76 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2856  myosin-cross-reactive antigen  40.22 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1703  myosin-cross-reactive antigen  41.92 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0307897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1741  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  39.1 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1856  myosin-cross-reactive antigen  40.11 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1592  myosin-cross-reactive antigen  40.68 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.188608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6310  myosin-cross-reactive antigen  40.64 
 
 		 543 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4626  myosin-cross-reactive antigen  38.1 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139015  normal  0.0304511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4625  myosin-cross-reactive antigen  38.6 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19626  normal  0.0201148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1715  myosin-cross-reactive antigen  31.37 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10287  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  30.22 
 
 		 556 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.785603 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03782  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  29.07 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09297  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03570)  31.09 
 
 		 589 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.17345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  30.51 
 
 		 518 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  30.51 
 
 		 518 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.66 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  34.21 
 
 		 511 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>