42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0175 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0497  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  51.01 
 
 
590 aa  637    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1063  myosin-cross-reactive antigen  56.83 
 
 
588 aa  710    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0175  myosin-cross-reactive antigen  100 
 
 
591 aa  1240    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4631  myosin-cross-reactive antigen  53.12 
 
 
591 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0097  myosin-cross-reactive antigen  54.64 
 
 
591 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1559  myosin-cross-reactive antigen  53.2 
 
 
590 aa  667    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0093  myosin-cross-reactive antigen  54.64 
 
 
591 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0147  myosin-cross-reactive antigen  68.64 
 
 
625 aa  887    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0505  myosin-cross-reactive antigen  52.02 
 
 
590 aa  643    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1351  myosin-cross-reactive antigen  54.88 
 
 
591 aa  670    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.26686  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0484  myosin-cross-reactive antigen  53.12 
 
 
596 aa  663    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000619929  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04700  myosin-cross-reactive antigen  60.3 
 
 
587 aa  749    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1029  myosin-cross-reactive antigen  54.56 
 
 
587 aa  675    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1056  myosin-cross-reactive antigen  69.04 
 
 
611 aa  897    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488016  hitchhiker  0.00102136 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0663  myosin-cross-reactive antigen  55.14 
 
 
591 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.727351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1172  myosin-cross-reactive antigen  60.3 
 
 
611 aa  741    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3601  myosin-cross-reactive antigen  56.59 
 
 
588 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1508  myosin-cross-reactive antigen  52.19 
 
 
590 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0390888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0745  myosin-cross-reactive antigen  59.9 
 
 
597 aa  756    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.207657  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0365  myosin-cross-reactive antigen  52.45 
 
 
597 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0362  myosin-cross-reactive antigen  52.45 
 
 
597 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2256  myosin-cross-reactive antigen  41.91 
 
 
659 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14733  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0238  myosin-cross-reactive antigen  41.83 
 
 
667 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322551  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3022  myosin-cross-reactive antigen  41.36 
 
 
661 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463393  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4805  myosin-cross-reactive antigen  41.44 
 
 
659 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2430  myosin-cross-reactive antigen  41.59 
 
 
659 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2856  myosin-cross-reactive antigen  39.47 
 
 
530 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1352  myosin-cross-reactive antigen  39.51 
 
 
655 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.856433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1192  myosin-cross-reactive antigen  39.33 
 
 
655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.108987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1741  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  37.69 
 
 
532 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1703  myosin-cross-reactive antigen  37.79 
 
 
531 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0307897  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4626  myosin-cross-reactive antigen  39.33 
 
 
519 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139015  normal  0.0304511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1856  myosin-cross-reactive antigen  37.32 
 
 
543 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6310  myosin-cross-reactive antigen  36.01 
 
 
543 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1592  myosin-cross-reactive antigen  37.8 
 
 
574 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.188608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4625  myosin-cross-reactive antigen  38.92 
 
 
519 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19626  normal  0.0201148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1715  myosin-cross-reactive antigen  33.27 
 
 
557 aa  288  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10287  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  28.28 
 
 
556 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.785603 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09297  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03570)  27.3 
 
 
589 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.17345  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03782  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  25.82 
 
 
564 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  32.73 
 
 
586 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  42.86 
 
 
522 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>