40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2430 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4805  myosin-cross-reactive antigen  84.52 
 
 
659 aa  1154    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1192  myosin-cross-reactive antigen  76.02 
 
 
655 aa  999    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.108987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2430  myosin-cross-reactive antigen  100 
 
 
659 aa  1367    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2256  myosin-cross-reactive antigen  90.9 
 
 
659 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14733  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3022  myosin-cross-reactive antigen  90.74 
 
 
661 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463393  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1352  myosin-cross-reactive antigen  75.71 
 
 
655 aa  995    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.856433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0238  myosin-cross-reactive antigen  67.44 
 
 
667 aa  919    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322551  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3601  myosin-cross-reactive antigen  42.63 
 
 
588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1063  myosin-cross-reactive antigen  43.14 
 
 
588 aa  469  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1172  myosin-cross-reactive antigen  44.23 
 
 
611 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908776  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1351  myosin-cross-reactive antigen  44.42 
 
 
591 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.26686  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0093  myosin-cross-reactive antigen  42.91 
 
 
591 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0097  myosin-cross-reactive antigen  42.91 
 
 
591 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1508  myosin-cross-reactive antigen  43.32 
 
 
590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0390888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0362  myosin-cross-reactive antigen  41.88 
 
 
597 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0365  myosin-cross-reactive antigen  42.07 
 
 
597 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21105  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0745  myosin-cross-reactive antigen  43.12 
 
 
597 aa  449  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.207657  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04700  myosin-cross-reactive antigen  44 
 
 
587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0505  myosin-cross-reactive antigen  43.12 
 
 
590 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.963399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0663  myosin-cross-reactive antigen  42.38 
 
 
591 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.727351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1559  myosin-cross-reactive antigen  42.13 
 
 
590 aa  442  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0175  myosin-cross-reactive antigen  41.59 
 
 
591 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0147  myosin-cross-reactive antigen  40.2 
 
 
625 aa  439  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1056  myosin-cross-reactive antigen  40.59 
 
 
611 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488016  hitchhiker  0.00102136 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1029  myosin-cross-reactive antigen  44.03 
 
 
587 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0497  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  40.51 
 
 
590 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1741  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein  38.19 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2856  myosin-cross-reactive antigen  40.97 
 
 
530 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0484  myosin-cross-reactive antigen  39.64 
 
 
596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000619929  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4631  myosin-cross-reactive antigen  39.53 
 
 
591 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1703  myosin-cross-reactive antigen  40.58 
 
 
531 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0307897  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1592  myosin-cross-reactive antigen  38.46 
 
 
574 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.188608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1856  myosin-cross-reactive antigen  39.85 
 
 
543 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4626  myosin-cross-reactive antigen  39.5 
 
 
519 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139015  normal  0.0304511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6310  myosin-cross-reactive antigen  39.7 
 
 
543 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4625  myosin-cross-reactive antigen  36.88 
 
 
519 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19626  normal  0.0201148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1715  myosin-cross-reactive antigen  33.27 
 
 
557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10287  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  30.76 
 
 
556 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.785603 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03782  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09970)  29.4 
 
 
564 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09297  67 kDa myosin-cross-reactive antigen family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03570)  32.81 
 
 
589 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.17345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>