More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1736 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 		 330 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4248  Mg2 transporter protein CorA family protein  69.04 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  61.18 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0554  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.57 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0985  divalent cation transporter  34.16 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0599  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.88 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0357357  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2010  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.91 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.313618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0457  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.58 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.36 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.1 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.65 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  29.23 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  29.23 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  29.23 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  29.23 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  29.23 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  29.23 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  29.23 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.92 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.31 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.31 
 
 		 357 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.7 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.39 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  29.97 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  29.09 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.9 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.21 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.13 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.27 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.83 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.31 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.06 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.65 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.6 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.01 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.2 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.27 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  27.97 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.52 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.19 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.54 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  27.16 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.27 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.16 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.35 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.95 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  25.25 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  25.08 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.43 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  22.6 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  27.05 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.04 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  23.37 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.37 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.37 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.53 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  26.32 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  27.47 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.92 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.32 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3423  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.74 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.707435  normal  0.494677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  27.04 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.44 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  25.23 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.88 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  22.98 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.57 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.72 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  24.32 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  25 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.72 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  24.44 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  26.11 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6010  magnesium/cobalt transport protein  22.22 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  20.95 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69570  magnesium/cobalt transport protein  23.02 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0054645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  21.27 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.57 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  21.68 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1769  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.28 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0675  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.15 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.4 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.65 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.1 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  22.34 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2658  hypothetical protein  58.33 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1967  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.4 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  21.82 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.96 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>