259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1621 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  100 
 
 
336 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.15 
 
 
344 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.88 
 
 
345 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.18 
 
 
345 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.44 
 
 
339 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.27 
 
 
347 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  33.78 
 
 
339 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.33 
 
 
342 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.33 
 
 
357 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.03 
 
 
372 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.68 
 
 
355 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.26 
 
 
328 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.73 
 
 
362 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  35.09 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.45 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.68 
 
 
342 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.9 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.33 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.33 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.56 
 
 
340 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.7 
 
 
346 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  34.16 
 
 
339 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  34.42 
 
 
340 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  31.11 
 
 
336 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  31.11 
 
 
340 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  31.11 
 
 
336 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  31.11 
 
 
336 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  31.11 
 
 
340 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  31.11 
 
 
340 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  31.11 
 
 
340 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.72 
 
 
342 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  30.65 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.25 
 
 
342 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  26.98 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.19 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  27.13 
 
 
327 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  27.04 
 
 
327 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  27.44 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  27.44 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  27.44 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  27.44 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  27.44 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  27.41 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  27.41 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  28.76 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  24.18 
 
 
327 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  24.51 
 
 
337 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  24.51 
 
 
337 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.52 
 
 
326 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.6 
 
 
322 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  25.96 
 
 
332 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.27 
 
 
330 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.39 
 
 
320 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  27.21 
 
 
323 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  25.87 
 
 
332 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.81 
 
 
325 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.48 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.57 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  26.47 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.69 
 
 
331 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  28.67 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0985  divalent cation transporter  25.74 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0457  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.81 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.89 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2010  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.91 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.313618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0554  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.59 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4248  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.17 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  27.13 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  23.38 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.13 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.62 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.67 
 
 
346 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0599  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.53 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0357357  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.13 
 
 
331 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.37 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.84 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.25 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.69 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  22.69 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.79 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  26.37 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.97 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.49 
 
 
327 aa  77  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  26.51 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.4 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.02 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  31.01 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.77 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.43 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.43 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.4 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.85 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>