More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0018 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
326 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  48.04 
 
 
327 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  47.63 
 
 
322 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.9 
 
 
325 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.9 
 
 
321 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  45.9 
 
 
325 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.57 
 
 
321 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  48.25 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  46.05 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  46.56 
 
 
330 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  45.62 
 
 
326 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  44.24 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  45.25 
 
 
325 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.22 
 
 
322 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  45.57 
 
 
325 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  43.89 
 
 
321 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  45.25 
 
 
325 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.87 
 
 
325 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  40.4 
 
 
327 aa  245  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  38.05 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  39.73 
 
 
327 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  40.26 
 
 
327 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  38.89 
 
 
337 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  38.89 
 
 
337 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  38.89 
 
 
327 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  37.35 
 
 
327 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  38.7 
 
 
324 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  39.24 
 
 
323 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  36.73 
 
 
327 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  36.73 
 
 
327 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  36.73 
 
 
327 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  36.73 
 
 
327 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  36.73 
 
 
327 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  42.42 
 
 
332 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  42.56 
 
 
332 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  36.02 
 
 
327 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.26 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.07 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.34 
 
 
331 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  42.02 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  42.02 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.41 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  39.33 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.73 
 
 
331 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.69 
 
 
326 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  39.33 
 
 
331 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.39 
 
 
329 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  37.24 
 
 
346 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  40.91 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  34.72 
 
 
327 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.65 
 
 
305 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  30.21 
 
 
317 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.72 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.33 
 
 
344 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.31 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.44 
 
 
362 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.82 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.15 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.9 
 
 
361 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  31.14 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.37 
 
 
345 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.85 
 
 
362 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.37 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.03 
 
 
345 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.25 
 
 
347 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.27 
 
 
342 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.27 
 
 
357 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.94 
 
 
370 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28 
 
 
372 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.18 
 
 
342 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.72 
 
 
342 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.18 
 
 
342 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.18 
 
 
342 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.55 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.8 
 
 
339 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  27.49 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  27.49 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  27.49 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  27.49 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  27.49 
 
 
336 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  27.49 
 
 
336 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  27.49 
 
 
340 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  28.32 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.72 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.72 
 
 
354 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.77 
 
 
354 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  28.97 
 
 
339 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.76 
 
 
341 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.31 
 
 
354 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.68 
 
 
367 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.52 
 
 
336 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.37 
 
 
356 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>