More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2318 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  97.55 
 
 		 327 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  100 
 
 		 327 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  79.43 
 
 		 327 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  78.68 
 
 		 323 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  73.6 
 
 		 337 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  73.6 
 
 		 337 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  72.78 
 
 		 327 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  72.17 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  66.06 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  63.91 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  63.91 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  63.91 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  63.61 
 
 		 327 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  63.61 
 
 		 327 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  64.22 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.73 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  39.12 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.42 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.96 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.46 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.08 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.2 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.15 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  37.15 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.15 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  35.29 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  35.09 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.04 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  34.8 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  39.37 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.58 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  34.66 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.78 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  36.7 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  33.96 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  34.66 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.27 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.67 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.67 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  34.37 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.02 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.37 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  36.56 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  35.44 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  36.24 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.02 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.05 
 
 		 331 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.37 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.12 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.56 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  30.66 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.74 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  28.38 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.21 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  23.75 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.13 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.56 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.79 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.37 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.81 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.31 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.41 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.16 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.05 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  24.21 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.51 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.97 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  22.97 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.97 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  22.98 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  22.78 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  22.78 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.16 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  22.78 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  22.78 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  22.78 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  22.78 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  22.42 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.46 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  22.05 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.57 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.91 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  22.92 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  22.11 
 
 		 355 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.11 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  29.24 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.74 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.39 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.88 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.41 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.5 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.48 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>