More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1737 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  100 
 
 
323 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  79.51 
 
 
327 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  78.68 
 
 
327 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  77.43 
 
 
327 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  69.28 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  69.28 
 
 
327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  69.28 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  68.15 
 
 
327 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  66.88 
 
 
327 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  65.61 
 
 
327 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  65.29 
 
 
327 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  65.61 
 
 
327 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  65.61 
 
 
327 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  65.29 
 
 
327 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  66.24 
 
 
327 aa  431  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.24 
 
 
326 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.46 
 
 
322 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  39.23 
 
 
327 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.63 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.59 
 
 
321 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  36.59 
 
 
325 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.59 
 
 
325 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.18 
 
 
325 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  35.58 
 
 
322 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.6 
 
 
320 aa  202  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  35 
 
 
324 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  37.04 
 
 
326 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  34.15 
 
 
331 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.24 
 
 
330 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.05 
 
 
331 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  35.07 
 
 
321 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.85 
 
 
331 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.86 
 
 
321 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  36.52 
 
 
332 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.49 
 
 
325 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.72 
 
 
325 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.38 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  35.19 
 
 
321 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  36.18 
 
 
332 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.74 
 
 
331 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.44 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  33.44 
 
 
332 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.44 
 
 
331 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.19 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.96 
 
 
346 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.79 
 
 
326 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  33.96 
 
 
321 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.15 
 
 
329 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.25 
 
 
305 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.64 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  28.92 
 
 
327 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.87 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  29.27 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.77 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  27.18 
 
 
362 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.83 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.26 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.03 
 
 
345 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.32 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.91 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.17 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.93 
 
 
346 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.57 
 
 
342 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  24.91 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  24.91 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  24.91 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  24.91 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.57 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.57 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  24.91 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.48 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.48 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  24.57 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  24.91 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  30.63 
 
 
375 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.21 
 
 
339 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  26.01 
 
 
340 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.21 
 
 
336 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.91 
 
 
344 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.37 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.92 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.96 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  22.64 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.73 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.18 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.26 
 
 
355 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.42 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  22.11 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.42 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.84 
 
 
316 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.58 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  24.58 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>