270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1498 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  100 
 
 		 331 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0985  divalent cation transporter  32.81 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.43 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.44 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.1 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0554  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.34 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0599  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.74 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0357357  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4248  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.23 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2010  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.44 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.313618 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  33.01 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  33.01 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  33.01 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0457  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.66 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  33.01 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  33.01 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  33.01 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  33.01 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.04 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.74 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.74 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.12 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.44 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.13 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.83 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.2 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.59 
 
 		 345 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.17 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.18 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  31.06 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  29.97 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.29 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.67 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  30.51 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.41 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.54 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.88 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.88 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.18 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.44 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.48 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.27 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.62 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  28.05 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  28.57 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.57 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.57 
 
 		 362 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  26.9 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  26.9 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  26.9 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.55 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  27.74 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  25.3 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  26.71 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  27.05 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.19 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.08 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  26.47 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  28.07 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.07 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.24 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.61 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.48 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  23.86 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  26.53 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  24.57 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  24.57 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.57 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  24.57 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  24.57 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  24.57 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.02 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.64 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  23.44 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  25 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.27 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.33 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  27.1 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.29 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.37 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.91 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  25.91 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.91 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.38 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  24.15 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.98 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  25.97 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  22.33 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  25.83 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.18 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  25.98 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  24.24 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0585  hypothetical protein  21.81 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0123601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>