More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2085 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  100 
 
 		 332 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  100 
 
 		 331 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  97.28 
 
 		 331 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  93.05 
 
 		 331 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  76.13 
 
 		 331 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  77.04 
 
 		 331 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  77.04 
 
 		 331 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  60.98 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  61.14 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  64.91 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.02 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  38.91 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.89 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  39.94 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.22 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.87 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  35.87 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.91 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.46 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  39.44 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  36.53 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.6 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  35.6 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  36.22 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.37 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  34.37 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  35.91 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  32.4 
 
 		 327 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  35.91 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  36.22 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  34.06 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.04 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  32.2 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  33.44 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  30.53 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  30.53 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  30.53 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  38.31 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.27 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  35.96 
 
 		 317 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.13 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  29.6 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.38 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.75 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  28.35 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  34.64 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.85 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.6 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  28.77 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  28.77 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  28.77 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  28.77 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  28.77 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  28.77 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  28.77 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.59 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.59 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.59 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.52 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.36 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.59 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.59 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.19 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.87 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.43 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.62 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.52 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.6 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  26.44 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.23 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.9 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.65 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.42 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  26.65 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.13 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.21 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.73 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.82 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.55 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.62 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.87 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.57 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.64 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.68 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.17 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.37 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.29 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>