296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2858 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.21 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.79 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.65 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.42 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.03 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  30.64 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  30.56 
 
 		 327 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  30.56 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  31.25 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.1 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.63 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  30.38 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  30.38 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  31.38 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  30.38 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  31.6 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  30.69 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.28 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  30.28 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.28 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  29.86 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  28.82 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  28.82 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  28.82 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  28.82 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  28.82 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.87 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  29.79 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  29.23 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  28.17 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  28.87 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  28.87 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.47 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  32.2 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  28.28 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  31.86 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.39 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.45 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.76 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.62 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.9 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.2 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.85 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.85 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  30.85 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  31.51 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  26.9 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.76 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.2 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  26.04 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.03 
 
 		 346 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.76 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  32.35 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  29.11 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.85 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  23.33 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.75 
 
 		 354 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.63 
 
 		 354 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.83 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.83 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.83 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  24.32 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.21 
 
 		 361 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.34 
 
 		 354 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.83 
 
 		 347 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  25.53 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  25.35 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  25.35 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.33 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  25.35 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  25.35 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  25.35 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.09 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  25.35 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.92 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.58 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.48 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  24.58 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  28.15 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.23 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.04 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.58 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.84 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.85 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.3 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.75 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.37 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.93 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.18 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.26 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>