22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2930 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  85.2 
 
 		 223 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  31.93 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  29.38 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  39.62 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  39.62 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  39.62 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  41.54 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  39.71 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  33.56 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  30.67 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  33.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  24.78 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  41.54 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  37.93 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  36.21 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  37.84 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  32.94 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  36.21 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  32.76 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  32.81 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>