22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4165 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  80.75 
 
 
213 aa  315  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  78.24 
 
 
216 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  76.85 
 
 
216 aa  307  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  76.06 
 
 
208 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  73.36 
 
 
214 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  69.16 
 
 
211 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  38.43 
 
 
216 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  36.87 
 
 
216 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  33.16 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  33.16 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  31.5 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  34.66 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  31.66 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  31.43 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  30.65 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  28.76 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  30.67 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  31.76 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3941  hypothetical protein  24.4 
 
 
304 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0238639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  28.43 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>