22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0452 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  436  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  66.67 
 
 
216 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  42.47 
 
 
211 aa  158  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  39.07 
 
 
208 aa  148  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  38.89 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  38.07 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  36.7 
 
 
216 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  37.67 
 
 
213 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  36.87 
 
 
213 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  28.64 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  26.83 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  26.83 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  28.14 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  26.73 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  27.32 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  26.43 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  26.63 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  30.82 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  32.72 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  33.54 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  32.47 
 
 
267 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  32.81 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>