25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3008 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  32.17 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  31.93 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  39.17 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  39.17 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  36.97 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  38.05 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  27.7 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  30.65 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  51.79 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  27.15 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  32.35 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  29.91 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  28.3 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  26.42 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  25.85 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  25.42 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  26.51 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  26.63 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  36.21 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  25.79 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  26.74 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  31.09 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>