20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3410 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  417  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  89.81 
 
 		 216 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  84.72 
 
 		 213 aa  328  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  77.31 
 
 		 213 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  79.17 
 
 		 208 aa  321  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  80.56 
 
 		 214 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  68.84 
 
 		 211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  38.36 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  38.07 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  32.83 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  31.07 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  31.03 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  33.51 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  29.7 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  29.3 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  26.41 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  34.64 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  32.1 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  24.72 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>