22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1179 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  100 
 
 
213 aa  420  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  87.79 
 
 
208 aa  350  8e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  80.75 
 
 
213 aa  340  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  83.8 
 
 
216 aa  336  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  83.8 
 
 
216 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  80.84 
 
 
214 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  72.64 
 
 
211 aa  301  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  40.74 
 
 
216 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  37.67 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  35 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  33.64 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  32.66 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  36.96 
 
 
214 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  29.65 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  28.05 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  28.63 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  29.69 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  32.46 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  32.17 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  28.17 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  28.5 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  28.24 
 
 
267 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>