21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1199 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  89.81 
 
 
216 aa  353  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  78.24 
 
 
213 aa  330  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  81.94 
 
 
213 aa  327  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  80.56 
 
 
208 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  80.09 
 
 
214 aa  313  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  66.98 
 
 
211 aa  280  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  39.34 
 
 
216 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  38.91 
 
 
216 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  34.34 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  33.04 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  33.17 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  34.95 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  32.93 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  26.98 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  28.38 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  32.03 
 
 
223 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  25.29 
 
 
267 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  27.97 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>