22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1278 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  69.16 
 
 
213 aa  285  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  72.64 
 
 
213 aa  276  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  69.34 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  66.98 
 
 
216 aa  269  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  65.12 
 
 
216 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  70.42 
 
 
214 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  41.94 
 
 
216 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  42.47 
 
 
216 aa  158  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  33.95 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  35.53 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  35.12 
 
 
219 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  34.87 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  32.34 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  32.35 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  27.78 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  33.56 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  26.26 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  28.5 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  37.88 
 
 
213 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>