20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1412 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  100 
 
 
208 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  87.79 
 
 
213 aa  344  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  80.37 
 
 
214 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  78.7 
 
 
216 aa  322  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  79.17 
 
 
216 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  76.53 
 
 
213 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  69.81 
 
 
211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  39.35 
 
 
216 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  32.41 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  32.32 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  30.56 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  31.67 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  29.31 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  26.67 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  26.51 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  25.88 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  32.43 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  28.47 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  29.25 
 
 
223 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>