25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2841 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  417  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  44.98 
 
 
215 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  43.64 
 
 
215 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  43.54 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  40.95 
 
 
214 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  37.44 
 
 
211 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  32.14 
 
 
219 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  29.06 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  34.47 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  29.69 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  36.36 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  32.85 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  31.88 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  28.63 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  27.83 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  30.3 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  30.39 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  30.66 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  41.54 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  28.92 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  32.05 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>