25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4496 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  93.9 
 
 
229 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  47.25 
 
 
236 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  28.36 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  30.48 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  30.15 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  30.43 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  28.36 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  29.38 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  43.28 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  28.3 
 
 
247 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  29.19 
 
 
251 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  34.57 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  30.15 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  32.98 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  43.04 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  37.31 
 
 
267 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  36.23 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  33.96 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  37.68 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  24.63 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  30.77 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  39.13 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  28.08 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  30.43 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>