25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0669 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  60.19 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  59.26 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  58.6 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  40.95 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  36.02 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  35.62 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  35.57 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  36.53 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  34.52 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  34.85 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  31.95 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  33.02 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  30.88 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  37.4 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  38.89 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  29.65 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  28.79 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  36.11 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  28.92 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  26.35 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>