15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4184 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  95.95 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  89.47 
 
 		 247 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  40.7 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  29.27 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  25.42 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  42.42 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  30.08 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  37.93 
 
 		 223 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  34.92 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  40.91 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  36.21 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  36.51 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>