14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4101 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4101  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4184  hypothetical protein  89.47 
 
 
251 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0321  hypothetical protein  87.85 
 
 
247 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  30.77 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  38.71 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  32.88 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  31.58 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  25.32 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  38.1 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  42.42 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  36.51 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  36.21 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  40.91 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  25.66 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>