30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3288 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  99.45 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  73.18 
 
 		 182 aa  274  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  38.07 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  38.07 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  38.62 
 
 		 251 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  38.5 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  34.81 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  35.39 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  36.99 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  35.36 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  34.66 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  35.84 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  36.99 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  34.08 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  33.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  33.52 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  35.26 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  34.36 
 
 		 245 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  30.64 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  29.61 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  29.55 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  24.71 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  23.73 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  34.92 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>