27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1526 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  503  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  45.67 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  44.95 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  43.3 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  41.24 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  40.21 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  38.95 
 
 		 187 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  39.7 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  39.7 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  39.7 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  39.2 
 
 		 186 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  39.2 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  40.2 
 
 		 186 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  39.2 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  37.89 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  38.19 
 
 		 186 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  34.15 
 
 		 182 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  34.36 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  34.36 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  25.7 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  25.24 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  27.41 
 
 		 193 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  25.93 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  27.81 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  28.72 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  28.72 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  22.22 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>