30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1722 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  140  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  35.75 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  35.59 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  35.03 
 
 		 209 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  32.2 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  31.07 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  30.73 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  29.89 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  27.68 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  27.68 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  25.57 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  26.7 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  26.55 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  25.57 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  25.99 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  25.42 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  27.53 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  27.93 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  25.99 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  24.87 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  27.37 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  24.21 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  25.93 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  27.33 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  24.29 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  24.65 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>