30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2996 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  73.18 
 
 		 183 aa  274  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  72.63 
 
 		 183 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  40.78 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  40.22 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  38.73 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  36.93 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  37.99 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  38.07 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  37.57 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  34.15 
 
 		 245 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  35.08 
 
 		 251 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  35.08 
 
 		 255 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  35.2 
 
 		 193 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  35.26 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  34.64 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  34.64 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  29.89 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  33.53 
 
 		 193 aa  97.4  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  31.07 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  28.89 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  23.81 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  26.8 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>