30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4145 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  94.62 
 
 		 186 aa  361  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  94.62 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  93.01 
 
 		 186 aa  357  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  89.78 
 
 		 186 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  88.71 
 
 		 186 aa  345  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  75.68 
 
 		 186 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  75.14 
 
 		 186 aa  298  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  75.68 
 
 		 186 aa  297  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  73.51 
 
 		 186 aa  289  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  74.05 
 
 		 186 aa  285  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  67.93 
 
 		 187 aa  274  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  65.76 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  39.2 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  38.1 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  37.57 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  38.55 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  35.36 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  35.36 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  34.27 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  31.43 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  31.52 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  33.71 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  30.64 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  30.51 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  29.21 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  25.57 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  27.47 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  25.68 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  38.6 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>