30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1450 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  95.7 
 
 
186 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  94.62 
 
 
186 aa  359  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  94.09 
 
 
186 aa  358  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  92.47 
 
 
186 aa  357  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  91.4 
 
 
186 aa  353  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  77.84 
 
 
186 aa  307  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  76.76 
 
 
186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  76.22 
 
 
186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  73.51 
 
 
186 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  72.97 
 
 
186 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  66.85 
 
 
187 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  64.67 
 
 
186 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  40.2 
 
 
245 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  38.62 
 
 
255 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  38.1 
 
 
251 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  37.99 
 
 
182 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  34.66 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  34.66 
 
 
183 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  34.83 
 
 
194 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  30.64 
 
 
193 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  29.21 
 
 
193 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  30.51 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  25.42 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  25.42 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  28.32 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>