30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0639 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  94.09 
 
 		 186 aa  358  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  92.47 
 
 		 186 aa  354  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  84.41 
 
 		 186 aa  323  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  78.38 
 
 		 186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  78.38 
 
 		 186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  77.84 
 
 		 186 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  77.84 
 
 		 186 aa  307  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  76.76 
 
 		 186 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  75.68 
 
 		 186 aa  301  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  72.58 
 
 		 186 aa  288  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  67.93 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  65.22 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  39.2 
 
 		 245 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  35.45 
 
 		 255 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  34.92 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  32.18 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  29.89 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  30.64 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  31.61 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  31.15 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  27.93 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  27.37 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  27.62 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  27.12 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  23.53 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>