29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1316 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  379  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  95.7 
 
 
186 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  94.62 
 
 
186 aa  361  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  90.86 
 
 
186 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  90.86 
 
 
186 aa  352  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  76.76 
 
 
186 aa  307  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  75.14 
 
 
186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  75.68 
 
 
186 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  73.51 
 
 
186 aa  291  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  74.05 
 
 
186 aa  287  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  65.76 
 
 
187 aa  268  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  63.59 
 
 
186 aa  259  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  39.7 
 
 
245 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  38.1 
 
 
255 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  37.57 
 
 
251 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  34.81 
 
 
183 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  34.81 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  34.83 
 
 
194 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  32.07 
 
 
209 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  32.07 
 
 
209 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  30.64 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  31.07 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  25.99 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  28.26 
 
 
200 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>