30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3380 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  97.31 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  91.4 
 
 		 186 aa  353  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  91.4 
 
 		 186 aa  353  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  90.86 
 
 		 186 aa  352  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  88.71 
 
 		 186 aa  345  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  78.38 
 
 		 186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  77.84 
 
 		 186 aa  309  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  78.38 
 
 		 186 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  75.14 
 
 		 186 aa  293  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  71.35 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  69.02 
 
 		 187 aa  276  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  66.85 
 
 		 186 aa  267  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  40.21 
 
 		 245 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  39.68 
 
 		 255 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  39.15 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  40.22 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  38.07 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  38.07 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  33.71 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  31.52 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  31.52 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  33.15 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  29.61 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  31.21 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  27.68 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  27.89 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  24.86 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  28.47 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>