28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0620 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  28.14 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  29.44 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  28.14 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  28.89 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  24.29 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  28.42 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  28.42 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  28.26 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  27.89 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  25.28 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  28.26 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  28.42 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  27.47 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  27.62 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  28.19 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  28.42 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  28.42 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  27.42 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  24.05 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  26.55 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  23.73 
 
 
183 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  23.73 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  31.96 
 
 
184 aa  51.6  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  23.53 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  23.59 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  23.53 
 
 
251 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>