29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2091 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  59.79 
 
 
194 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  56.99 
 
 
194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  37.17 
 
 
193 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  34.66 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  36.09 
 
 
209 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  37.08 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  29.89 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  31.07 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  31.07 
 
 
186 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  28.74 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  30.64 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  28.74 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  29.61 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  30.64 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  29.94 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  30.51 
 
 
186 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  30.51 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  27.01 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  28.8 
 
 
255 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  28.42 
 
 
251 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  31.07 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  27.17 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  27.81 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  23.53 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  24.46 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>