27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0640 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  27.04 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  27.04 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  24.65 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  25.28 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  24.82 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  26.67 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  24.29 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  27.74 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  28.47 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  25.17 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  30.28 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  28.32 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  28.32 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  23.53 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  24.24 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  28.3 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  28.3 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  24.84 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  30.85 
 
 		 245 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  24.84 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  27.43 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  27.43 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  27.86 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  26.19 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  26.19 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>