67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3993 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  98.81 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  98.81 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  63.33 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  62.22 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  68.6 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  54.12 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  62.71 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  48.86 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  52.87 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  57.81 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  54.88 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  51.56 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  48.21 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  49.18 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  35.64 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  52.94 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  46.77 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  46.77 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  46.77 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  49.06 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  48.39 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  51.92 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  36.14 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  42.11 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  38.57 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  48.15 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  48.15 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  44.62 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  41.18 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  42.59 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  41.27 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  32.81 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  32.81 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  32.81 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  32.93 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  39.62 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  43.86 
 
 		 108 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  31.65 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  32.89 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>