66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3857 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  98.82 
 
 
85 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  98.82 
 
 
85 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  94.12 
 
 
92 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  58.82 
 
 
84 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  57.65 
 
 
84 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  57.65 
 
 
84 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  56.47 
 
 
84 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  54.55 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  53.41 
 
 
88 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  45.98 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  49.33 
 
 
75 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  44.19 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  42.05 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  47.83 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  38.64 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  42.68 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  45.61 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  43.75 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  36.11 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  36.11 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  36.11 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  39.73 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  40.98 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  41.07 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  48.08 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  43.66 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  52.27 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  45.16 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  44.23 
 
 
78 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  45.16 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  48.89 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  42.19 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  45.45 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  37.93 
 
 
109 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  39.66 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  36.9 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  35.38 
 
 
88 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  38.18 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  39.58 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  35.71 
 
 
86 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  39.71 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  38.03 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  32.88 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  34.55 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  34.55 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  30.95 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17720  hypothetical protein  35.14 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.877133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  33.96 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  31.4 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  37.74 
 
 
91 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>