48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0042 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  97.22 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  34.86 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  41.1 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  44.93 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1165  hypothetical protein  37.08 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  0.18975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  33.66 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  39 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  35.62 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  32.11 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  46.15 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  32.11 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  32.11 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  48 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  31.37 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  38.36 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  43.14 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  39.62 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  28.16 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  42.62 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  39.29 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  35.85 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  38.57 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  39.29 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  40.74 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  44.19 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  38.18 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  38.18 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  40.38 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  36 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  38.64 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>