44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1897 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  182  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  98.86 
 
 		 88 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  51.11 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  34.44 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  37.31 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  37.33 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  34.72 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  34.72 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  34.72 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  34.72 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  32.56 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  37.1 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  31.4 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  31.4 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  31.4 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  41.3 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  32.79 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  39.13 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  30.23 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  32.69 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  40.38 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  32.69 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  36.54 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  33.85 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  29.82 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  29.41 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  30.95 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  34.12 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  30.99 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  26.76 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  26.76 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  26.76 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  26.23 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>