45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1715 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  96.63 
 
 		 89 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  51.19 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  50.59 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  43.68 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  40.26 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  41.18 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  39.53 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  39.76 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  39.76 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  39.76 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  40.23 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  39.76 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  32.58 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  55.32 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  42.03 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  34.83 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  48.94 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  32.18 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  32.18 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  37.65 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  37.84 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  44.44 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  26.47 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  48.89 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  27.52 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  40.82 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  48.08 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  35.56 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>