50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0995 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  45.78 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  44.71 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  40.48 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  50.68 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  41.1 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  40.96 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  37.8 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  36.14 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  42.42 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  36.59 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  44.64 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  35.8 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  32.95 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  32.95 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  34.57 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  34.57 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  40.48 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  41.67 
 
 
75 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  41.38 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  32.1 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  32.14 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  32.14 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  36.05 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  41.27 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  32.14 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  41.82 
 
 
91 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  45.1 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  34.38 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  40.35 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  40.62 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  41.54 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  30.95 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  36.76 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  40.74 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  35.63 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  34.92 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  34.92 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  34.92 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  36.99 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  39.29 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  38.98 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.962387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>