61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  49.41 
 
 
90 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  45.88 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  45.88 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  45.88 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  44.71 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  54.84 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  54.84 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  52.63 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  45.88 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  44.32 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  42.05 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  37.65 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  36.47 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  36.47 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  36.47 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  41.18 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  51.85 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  53.7 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  48.44 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  40.7 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  42.47 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  35.87 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  36.17 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  49.09 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  34.78 
 
 
110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  37.04 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  37.04 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  47.46 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  37.04 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  37.04 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  34.15 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  45.28 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  36.59 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  34.83 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  41.82 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  39.02 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  41.82 
 
 
89 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  33.72 
 
 
86 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  34.85 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  38.71 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  38.71 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  38.71 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  38.71 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  40.26 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  34.48 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  40.35 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  44.44 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  42.11 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.772409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>