55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3091 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  60.71 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  48.28 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  46.59 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  54.79 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  47.13 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  42.68 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  42.68 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  42.68 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  49.4 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  44.58 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  38.64 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  39.76 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  38.37 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  55.77 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  55.77 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  52 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  55.32 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  48.21 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  48 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  36.51 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  29.89 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  37.65 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  33.87 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  35.06 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  42.11 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  36.51 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  34.43 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  34.43 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  29.87 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  31.51 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  39.62 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  36.25 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17720  hypothetical protein  33.75 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.877133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  35.59 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>