51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2631 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  48.84 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  54.1 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  34.88 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  37.21 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  48.39 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  48.39 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  48.39 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  48.39 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  40.68 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  40.28 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  36.14 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  40.68 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  35.85 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  40.68 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  37.29 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  37.29 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  37.29 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  42.31 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  42.19 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  43.4 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  32.56 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  34.41 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  42.59 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  36.54 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  36.54 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  39.34 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  37.68 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  37.04 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  39.29 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>