42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3291 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  75.26 
 
 		 97 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  92.31 
 
 		 91 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  92.31 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  43.01 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  42.35 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  52 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  41.94 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  38.36 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  29.63 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  39.19 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  43.64 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  36.76 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  34.88 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  38.6 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  41.51 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  35.94 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  38.6 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  35.94 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  34.29 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  35.94 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  37.74 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  40.82 
 
 		 89 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  34.15 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  43.64 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  35.09 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  43.64 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>