47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3494 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  88.37 
 
 		 86 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  97.67 
 
 		 86 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  74.16 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  47.62 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  40.23 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  40.23 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  41.98 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  40.23 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  34.48 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  37.93 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  43.9 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  38.82 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  35.8 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  38.82 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  44.78 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  45.07 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  47.54 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  37.65 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  42.35 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  37.93 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  48.15 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  39.06 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4294  hypothetical protein  39.34 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474995  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4154  hypothetical protein  38.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  43.4 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  42.31 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  35.23 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  35.21 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  36.62 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  34.57 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  38.6 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1897  hypothetical protein  34.83 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  32.1 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22420  hypothetical protein  34.83 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000849865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03960  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3378  hypothetical protein  35.06 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3091  hypothetical protein  37.74 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>