More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2677 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3173  N-ethylmaleimide reductase  95.07 
 
 
365 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2677  N-ethylmaleimide reductase  100 
 
 
365 aa  737    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.471703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2697  N-ethylmaleimide reductase  92.33 
 
 
365 aa  688    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2543  N-ethylmaleimide reductase  95.89 
 
 
365 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543152  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  531  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  68.98 
 
 
365 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  69.81 
 
 
365 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  69.81 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  69.53 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  69.81 
 
 
365 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  69.81 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01620  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  69.25 
 
 
365 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.25 
 
 
365 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1727  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1861  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01610  hypothetical protein  69.25 
 
 
365 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00066304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2362  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.003891  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1979  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0402402  hitchhiker  0.00127595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1548  N-ethylmaleimide reductase  69.25 
 
 
365 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  68.7 
 
 
365 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1842  N-ethylmaleimide reductase  68.14 
 
 
365 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234054  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0341  N-ethylmaleimide reductase  57.73 
 
 
366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000113831  hitchhiker  0.00000000671042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0182  N-ethylmaleimide reductase  57.97 
 
 
367 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0201  N-ethylmaleimide reductase  56.87 
 
 
367 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  55.07 
 
 
378 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.64 
 
 
368 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.97 
 
 
368 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.37 
 
 
369 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.62 
 
 
364 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4790  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.45 
 
 
367 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.674778  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0508  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.3 
 
 
365 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  50.14 
 
 
369 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  46.67 
 
 
367 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  48.91 
 
 
370 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  50.14 
 
 
372 aa  332  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.32 
 
 
370 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  45.6 
 
 
374 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.95 
 
 
371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  45.3 
 
 
363 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.27 
 
 
371 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  50 
 
 
368 aa  324  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.35 
 
 
371 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
363 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.75 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  48.24 
 
 
370 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.53 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  42.86 
 
 
365 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.36 
 
 
368 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.25 
 
 
364 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  46.52 
 
 
385 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.01 
 
 
369 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.63 
 
 
371 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  47.14 
 
 
365 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.3 
 
 
365 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  47.24 
 
 
373 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.72 
 
 
374 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.74 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.25 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family  45.21 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  48.33 
 
 
360 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.9 
 
 
404 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.15 
 
 
368 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.78 
 
 
363 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.6 
 
 
372 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.72 
 
 
404 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.36 
 
 
371 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.26 
 
 
378 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.53 
 
 
378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  47.01 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.44 
 
 
374 aa  308  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
375 aa  308  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.63 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.73 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5449  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.63 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.09 
 
 
371 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5413  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.63 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.74 
 
 
371 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.36 
 
 
362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.79 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2424  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.11 
 
 
371 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397481  normal  0.0764227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  44.14 
 
 
375 aa  305  7e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.34 
 
 
358 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  47.3 
 
 
371 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  47.3 
 
 
371 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.14 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  48.09 
 
 
362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  48.34 
 
 
349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.25 
 
 
363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2152  oxidoreductase, FMN-binding  45.75 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  46.69 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.71 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.65 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.22 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.38 
 
 
372 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  45.36 
 
 
366 aa  301  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  44.29 
 
 
367 aa  301  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 
363 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>